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Identificação, classificação e anotação de enzimas análogas em tripanossomatídeos Identificação, classificação e anotação de enzimas análogas em tripanossomatídeos

by Ramos Guimarães, Ana Carolina

Abstract (Summary)
As enzimas são proteínas capazes de catalisar reações químicas. As enzimas análogas, ou formas alternativas de uma determinada função enzimática, são entidades bastante interessantes para o desenvolvimento de estudos sobre a evolução de genes e vias metabólicas porque possuem origem evolutiva independente. As enzimas análogas também representam potenciais alvos para drogas, muitas vezes ignorados e/ou subestimados devido aos próprios critérios de busca e seleção destes alvos, usualmente baseados na especificidade de funções enzimáticas e não na origem evolutiva das diferentes formas de uma determinada enzima. Neste trabalho, foi implementada uma ferramenta (AnEnp) capaz de: agrupar seqüências primárias protéicas e visualização dos mesmos; realizar buscas por similaridade via BLAST e/ou HMMER e reconstruir mapas metabólicos. Com esta ferramenta foi possível analisar dados sobre a presença/ausência de determinadas funções enzimáticas nos genomas de Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei e Leishmania major. Estes dados foram compilados, armazenados e analisados. Além disso, foi estudada a variabilidade das vias metabólicas, levando em conta a existência de eventos de analogia entre os ripanossomatídeos e humanos. A ferramenta foi utilizada na compilação de uma lista de possíveis alvos para desenvolvimento de novas drogas. As enzimas são proteínas capazes de catalisar reações químicas. As enzimas análogas, ou formas alternativas de uma determinada função enzimática, são entidades bastante interessantes para o desenvolvimento de estudos sobre a evolução de genes e vias metabólicas porque possuem origem evolutiva independente. As enzimas análogas também representam potenciais alvos para drogas, muitas vezes ignorados e/ou subestimados devido aos próprios critérios de busca e seleção destes alvos, usualmente baseados na especificidade de funções enzimáticas e não na origem evolutiva das diferentes formas de uma determinada enzima. Neste trabalho, foi implementada uma ferramenta (AnEnp) capaz de: agrupar seqüências primárias protéicas e visualização dos mesmos; realizar buscas por similaridade via BLAST e/ou HMMER e reconstruir mapas metabólicos. Com esta ferramenta foi possível analisar dados sobre a presença/ausência de determinadas funções enzimáticas nos genomas de Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei e Leishmania major. Estes dados foram compilados, armazenados e analisados. Além disso, foi estudada a variabilidade das vias metabólicas, levando em conta a existência de eventos de analogia entre os ripanossomatídeos e humanos. A ferramenta foi utilizada na compilação de uma lista de possíveis alvos para desenvolvimento de novas drogas.
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Bibliographical Information:

Advisor:Antônio Basílio de Miranda; Wim Maurits Sylvain Degrave

School:Faculdades Oswaldo Cruz

School Location:Brazil

Source Type:Master's Thesis

Keywords:BIOLOGIA MOLECULAR

ISBN:

Date of Publication:06/29/2006

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