Details

Análise diferencial da expressão gênica de cultura primária decélulas musculares esqueléticas durante a infecção com taquisoítos de toxoplasma gondii.

by Afornali, Alessandro

Abstract (Summary)
A metodologia de microarranjo é uma poderosa ferramenta para a análise de expressão diferencial ocorrida durante a infecção por um patógeno. O presente trabalho se propõe a estudar oprocesso biológico a nível transcricional da resposta da célula hospedeira à infecção causada pelo parasita intracelular obrigatório Toxoplasma gondi,i através do uso da técnica de microarranjo de alta densidade (GeneChip®). Foram avaliados os tempos de 30 minutos, 4 horas e 24 horas de infecção, utilizando células de cultura primária de tecido muscular esquelético murino infectadas com taquizoítas da cepa RH de Toxoplasma gondii. Neste trabalho foram selecionados 22genes candidatos para o processo infectivo através da correlação entre dois métodos de análise, Li-Wong e gcRMA. Uma análise por ontologia (GO) evidenciou diversos processos biológicos durante a infecção estudada. Uma análise comparativa com o trabalho de BLADER e colaboradoresrevelou uma boa correlação dos dados. Em nossos resultados obtivemos 42 genes selecionados em 30 minutos, 95 genes selecionados em 4 horas e 631 genes selecionados em 24 horasque passaram pelo critério estatístico e de razão de mudança maior que 1,75 vez. Destes 631 genes, 435 tinham processo celular anotado, sendo que 120 genes (27,6%) estão envolvidos no metabolismo de aminoácidos e nucleotídeos, 78 genes (17,9%) estão envolvidos na regulação transcricional,77 genes (17,7%) estão envolvidos na sinalização celular, 44 genes (10,1%) estão envolvidos no metabolismo de lipídeos e carboidratos, 29 genes (6,7%) estão envolvidos no ciclo celular,28 genes (6,4%) estão envolvidos na adesão celular e citoesqueleto, 24 genes (5,5%) estão envolvidos na síntese protéica e degradação, 22 genes (5,1%) estão envolvidos na apoptose e 8 genes (1,8%) estão envolvidos em processos inflamatórios. Posteriormente, o programa IngenityPathways Analysis 3.1 foi utilizado para a construção de redes de interação e regulação de proteínas. Através desta análise foi possível selecionar as principais redes moduladas durante a infecção. Nosso trabalho identificou muitas mudanças na expressão de diversos genes envolvidos na fusão e no transporte mediado por vesícula, incluindo as proteínas Rabs e proteínas acessórias do complexo, genes envolvidos na resposta inflamatória, genes envolvidos em apoptose e genesenvolvidos no ciclo celular, dentre outros, que servirão para a realização de análises biológicas posteriores.
This document abstract is also available in English.
Bibliographical Information:

Advisor:Christian Macagnan Probst; Marco Aurélio Krieger

School:Faculdades Oswaldo Cruz

School Location:Brazil

Source Type:Master's Thesis

Keywords:Expressão Gênica Toxoplasmose Células Musculares BIOLOGIA MOLECULAR

ISBN:

Date of Publication:06/14/2006

© 2009 OpenThesis.org. All Rights Reserved.