Desenvolvimento de abordagem computacionais e ferramentas para a análise comparativa de genomas microbianos

by Catanho de, Marcos Paulo

Esta dissertação trata do desenvolvimento de abordagens computacionais e ferramentas para a análise comparativa de genomas microbianos em larga escala. Três sistemas independentes, porém complementares, desenvolvidos para a análise comparativa de genomas microbianos em geral e micobacterianos em particular são apresentados: LocalCOG, sistema composto por um banco de dados relacional que permite o uso local das informações disponíveis no banco de dados COG (Cluster of Orthologous Groups); BioParser, programa que oferece interfaces gráficas para a manipulação e análise de resultados obtidos com o uso de programas de busca por similaridade de seqüência; GenoMycDB, banco de dados relacional construído para a análise comparativa de genomas micobacterianos ao nível de suas proteínas preditas.